如何使用自動計數功能?
自動計數功能,將細胞影像進行二值化處理,透過軟體演算法進行自動計數,得到細胞數量,使用者可依照設定的長軸、短軸、面積等方式選擇目標細胞。
有關自動計數操作,請參閱以下教學影片。
操作步驟:
1)開啟軟體,導入一張細胞影像,切換到【自動計數】模組。
2)點選【開始計數】開啟該功能。
3)在預覽畫面右側選擇自動計數區域,使用者可依需求選擇全部、矩形、多邊形,點選下一步即可得到二值圖。
4)依左側原圖,分割右側二值化影像,若【自動暗】與【自動亮】無法滿足要求,可切換到手動模式調整色階。
5)調整色階後,可以透過形態學運算去除背景上的誤差訊號。
6)選擇是否補洞,效果如下圖:
7)選擇顯示模式:輪廓或區域。
l Conile:使用輪廓線來表示分割的細胞。
l 區域:用來表示分割細胞的填充。
8) 根據左邊的原圖,將右邊的二值單元格影像進行剪切,選擇先自動剪切或手動剪切。
9)依需求計算邊界的儲存格,勾選【包含邊界】,點選下一步。
10) 選擇需要統計的目標數據,並設定閾值,點選【確定】完成自動統計,得到自動統計結果如下圖所示:
11)在預覽視窗下方的資料列中可以看到自動計數統計的結果,如下圖所示,使用者可以根據需求選擇是否要匯出資料。
筆記:
1)自動計數功能,只能統計細胞數量,無法進行細胞分類。
2)盡量選擇背景與細胞訊號差異較小的影像,如果差異較小,則無法實現自動計數。