如何使用自动计数功能?
自动计数功能,对细胞图像进行二值化处理,通过软件算法进行自动计数,得到细胞数量,用户可以根据设定的长轴、短轴、面积等方式选择目标细胞。
对于自动计数操作,请参阅以下教程视频。
操作步骤:
1)打开软件,导入一张细胞图像,切换到【自动计数】模块。
2)点击【开始计数】开启该功能。
3)在预览画面右侧选择自动计数区域,用户可根据需求选择全部、矩形、多边形,点击下一步即可得到二值图。
4)根据左侧原图,分割右侧二值化图像,若【自动暗】与【自动亮】无法满足要求,可切换到手动模式调整色阶。
5)调整色阶后,可以通过形态学运算去除背景上的误差信号。
6)选择是否补洞,效果如下图所示:
7)选择显示模式:轮廓或区域。
l Conile:使用轮廓线来表示分割的细胞。
l 区域:用于表示分割细胞的填充。
8) 根据左边的原图,对右边的二值单元格图像进行剪切,选择先自动剪切还是手动剪切。
9)根据需要计算边界的单元格,勾选【包含边界】,点击下一步。
10) 选择需要统计的目标数据,并设置阈值,点击【确定】完成自动统计,得到自动统计结果如下图所示:
11)在预览窗口下方的数据栏中可以看到自动计数统计的结果,如下图所示,用户可以根据需求选择是否导出数据。
笔记:
1)自动计数功能,只能统计细胞数量,不能进行细胞分类。
2)尽量选择背景与细胞信号差异较小的图像,如果差异较小,则无法实现自动计数。