Dostupni su brojni softverski paketi za upravljanje kamerama, koji pružaju rješenja koja odgovaraju nizu zahtjeva za jednostavnošću, prilagođenim upravljanjem i programiranjem te integracijom u postojeće postavke. Različite kamere nude kompatibilnost s različitim softverskim paketima.

Mosaic je novi softverski paket tvrtke Tucsen. S moćnim upravljanjem kamerom, Mosaic nudi bogat skup značajki, od jednostavnog sučelja do naprednijih analitičkih alata poput brojanja bioloških stanica. Za monokromatske znanstvene kamere,Mozaik 1.6preporučuje se. Za kamere u boji,Mozaik V2nudi još prošireniji skup značajki i novo korisničko sučelje.
Mikromenadžerje softver otvorenog koda za upravljanje i automatizaciju mikroskopskih kamera i hardvera, široko korišten u znanstvenom snimanju.
LabVIEWje grafičko programsko okruženje tvrtke National Instruments koje koriste znanstvenici i inženjeri za razvoj automatiziranih sustava za istraživanje, validaciju i testiranje proizvodnje.
MatlabMathWorks je platforma za programiranje i numeričko računanje koju koriste znanstvenici i inženjeri za upravljanje hardverom, analizu podataka, razvoj algoritama i stvaranje modela.
EPOVIje Sustav za eksperimentalnu fiziku i industrijsko upravljanje, skup softverskih alata, biblioteka i aplikacija otvorenog koda za sustave upravljanja u stvarnom vremenu za znanstvene instrumente i eksperimente.
MaxIm DL je moćan softver za upravljanje astronomskim kamerama za akviziciju, obradu i analizu slika.
Samplepro je prethodni softverski paket za snimanje slika tvrtke Tucsen. Sada se umjesto njega preporučuje Mosaic.