Myndgreining lifandi frumna skráir hegðun og starfsemi frumna við lífeðlisfræðilega mikilvægar aðstæður, þar á meðal frumuflutninga, skiptingu, virkjun boðleiða og breytingar á undirfrumubyggingu. Hún veitir mikilvæg verkfæri til að skilja frumustarfsemi, sjúkdómsferli og áhrif lyfja og er víða notuð bæði í grunnrannsóknum í lífvísindum og lyfjaþróun.

Helstu áskoranirnar eru meðal annars kraftmikil eðli lifandi frumna, veik merkjastyrkur og næmi umhverfisins fyrir hitastigi, CO₂-þéttni og rakastigi. Þessar áskoranir krefjast myndavéla með mikilli næmni til að greina dauf merki, lágs suðs til að tryggja myndgæði og mikillar rammatíðni til að taka upp hraða kraftmikla atburði, sem tryggir áreiðanlegar og endurtakanlegar athuganir á lifandi frumum.