Dostępnych jest wiele pakietów oprogramowania do sterowania kamerami, które oferują rozwiązania spełniające szereg wymagań w zakresie prostoty, niestandardowego sterowania i programowania oraz integracji z istniejącymi konfiguracjami. Różne kamery oferują kompatybilność z różnymi pakietami oprogramowania.

Mosaic to nowy pakiet oprogramowania firmy Tucsen. Dzięki zaawansowanemu sterowaniu kamerą, Mosaic oferuje bogaty zestaw funkcji, od prostego w obsłudze interfejsu po bardziej zaawansowane narzędzia analityczne, takie jak liczenie komórek biologicznych. W przypadku monochromatycznych kamer naukowych,Mozaika 1.6jest zalecane. W przypadku kamer kolorowych,Mozaika V2oferuje jeszcze bardziej rozbudowany zestaw funkcji i nowy interfejs użytkownika.
Mikromenedżerjest oprogramowaniem typu open source przeznaczonym do sterowania i automatyzacji kamer mikroskopowych oraz sprzętu, szeroko stosowanym w obrazowaniu naukowym.
LabVIEWto graficzne środowisko programistyczne firmy National Instruments, wykorzystywane przez naukowców i inżynierów do tworzenia zautomatyzowanych systemów badawczych, walidacyjnych i produkcyjnych.
MatlabMathWorks to platforma programistyczna i obliczeniowa wykorzystywana przez naukowców i inżynierów do sterowania sprzętem, analizowania danych, opracowywania algorytmów i tworzenia modeli.
EPICSto System Fizyki Eksperymentalnej i Kontroli Przemysłowej, zbiór narzędzi programowych, bibliotek i aplikacji o otwartym kodzie źródłowym dla systemów sterowania w czasie rzeczywistym dla instrumentów naukowych i eksperymentów.
MaxIm DL to zaawansowane oprogramowanie do sterowania kamerą astronomiczną, służące do akwizycji, przetwarzania i analizy obrazu.
Samplepro to poprzedni pakiet oprogramowania do przechwytywania obrazu firmy Tucsen. Obecnie zaleca się zastąpienie go programem Mosaic.